玻璃瓶三合一灌裝機在灌裝和旋蓋之間需要安裝一噴洗裝置，通過光電檢測， 當有瓶子通過時，對瓶口噴射純水，將灌裝時候殘留在瓶口螺旋口處的果汁飲料噴洗干凈，以免后續瓶口滋生細菌。從嚴格安全角度來說，果汁飲料封口后還需要倒瓶殺菌和噴淋殺菌冷卻，這也叫二次殺菌，倒瓶主要利用果汁飲料的溫度對瓶蓋內部進行殺菌。噴淋殺菌也 稱之為巴氏殺菌，然后立即將溫度降下來，果汁物料長期處于高溫狀態會使內部影響成分缺失，影響口感以及顏色。

果汁飲料生產線根據原料不同分為鮮果汁榨汁、果粉調制、混合性果汁飲料。鮮果榨汁種類又可以分為：濁汁、青汁。濁汁含有果肉或者果汁的可溶性固形物比較高能，或者是NFC的果汁，果汁含量高，含有果肉一類的果汁飲料也算是濁汁， 飲料按酸堿性可分為：酸性的果汁飲料和中性的果汁飲料，中性的果汁飲料又叫植物蛋白飲料。椰子汁、大豆飲料、花生乳、核桃乳、杏仁露。