常溫灌裝和無菌冷灌裝是兩種不同的灌裝方式，它們之間的主要區別在于工藝流程和產品受熱時間。

1. 工藝流程：常溫灌裝通常是在產品滅菌后，在常溫下進行灌裝，然后進行二次滅菌，以保障產品的保質期。而無菌冷灌裝是在產品滅菌后，進行瞬時超高溫殺菌，然后迅速冷卻到常溫，并在無菌環境下進行灌裝和封口，以保持產品原有的口感、色澤和風味。
2. 產品受熱時間：常溫灌裝的產品在二次滅菌過程中會受到一定的熱量影響，可能對產品的色澤、風味和營養產生一定的影響。而無菌冷灌裝的產品采用瞬時超高溫殺菌，然后迅速冷卻到常溫，因此產品受熱時間較短，對產品的色澤、風味和營養的影響較小。
3. 生產線配置：常溫灌裝的產品在二次滅菌過程中可能對產品質量產生一定的影響，因此需要配備殺菌設備。而無菌冷灌裝的產品在無菌環境下進行灌裝和封口，不需要配備殺菌設備，因此可以減少生產線的配置時間和成本。

常溫灌裝和無菌冷灌裝的主要區別在于工藝流程、產品受熱時間和生產線配置方面，而無菌冷灌裝相對于常溫灌裝更能保持產品原有的口感、色澤和風味。