無菌灌裝機廣泛應用于果汁，果漿和果醬等流體食品的無菌包裝。室溫下，產品可保存一年以上，可省去低溫冷藏運輸的費用及風險。

飲料灌裝機全自動生產線程序流程：

裝裝空罐的小箱子被堆積在拖盤上，由輸送皮帶運輸到卸貨機，將拖盤逐一卸掉，隨后由輸送皮帶運輸到卸貨機，那樣空罐就從小箱子里拿出來了，空罐就被輸送皮帶運輸到洗箱機，清洗后再運輸到裝箱機，那樣裝裝飲品的玻璃瓶便會放進去。由卸箱機取下的空罐，由另一輸送帶送進洗瓶機開展消毒殺菌清理，經瓶檢檢測，合乎清理規范后，送至自動灌裝機及旋蓋機。用自動灌裝機將飲品罐裝。用旋蓋機對裝礦泉水瓶開展密封，隨后將瓶塞送至自動貼標機上貼上標簽，貼好標識后送至裝箱機上裝進箱里，再送至堆拖盤機里堆到庫房。

依據罐裝基本原理，將果肉飲料無菌灌裝機分成過熱蒸汽自動灌裝機、充壓自動灌裝機和真空泵自動灌裝機；

過熱蒸汽式自動灌裝機是在大氣壓力下根據液體自身重量開展罐裝的設備。這類充液器又分成定時執行充液器和允許充液器二種，僅適用充進高粘度無氣液體如牛乳、紅酒等。

髙壓自動灌裝機是在高過大氣壓力的狀況下開展罐裝，又可分成兩大類：一類是貯液主缸的工作壓力相當于瓶里工作壓力，靠液體果汁飲料灌裝機自身重量注入瓶里，稱之為等壓罐裝；另一類是貯液主缸的工作壓力高過瓶里工作壓力，靠液體壓力差注入瓶里，這類方式在髙速生產流水線多選用。該設備適用對葡萄酒、碳酸飲料、香檳酒等含氣液體的填充。